سنتز پپتید سفارشی به فرآیند سنتز پپتیدها یا پپتیدهایی با طول و ساختار خاص با افزودن مکرر اسیدهای آمینه از طریق پیوند پپتیدی با توجه به نیازهای خاص مشتریان اشاره دارد. این فرآیند می تواند شامل تکنیک ها و فرآیندهای مختلفی از جمله سنتز پپتید فاز مایع و سنتز پپتید فاز جامد باشد. محصول نهایی باید با روش هایی مانند کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا (HPLC) خالص شود تا از کیفیت و دقت ساختاری آن اطمینان حاصل شود.