واژه نامه

تلفن

+86-0755 2308 4243
آدرس

اتاق 309، ساختمان میهوا، پارک صنعتی تایوان، خیابان سونگ بای شماره 2132، منطقه بائوآن، شنژن، چین
ایمیل

sales@biorunstar.com

واژه نامه

٪7b٪7b0٪7d٪7dAbz

2-Abz - 2-آمینوبنزوئیل، معمولاً با 2،4-دی‌نی‌تروفنیل (Dnp) یا 3-نیترو تیروزین (NitroTyr) ترکیب می‌شود تا جفت‌های فلوروفور/کوئنچر را تشکیل دهد. تحریک در 320 نانومتر، انتشار در 420 نانومتر.

٪7b٪7b0٪7d٪7dAbz

3-Abz (m-aminobenzoic acid) را می توان به عنوان یک اسید آمینه مشاهده کرد. هنگامی که m-aminobenzoic اسید در زنجیره های پپتیدی گنجانده می شود، منجر به چرخش سفت و سخت می شود.

4-Abz

4-Abz (p-Aminobenzoic acid، PABA)، که یک مشتق طبیعی اسید بنزوئیک است، همچنین می‌تواند به عنوان یک فاصله‌دهنده خطی صلب استفاده شود.

ابو

Abu، L- -Aminobutyryl ((S)-2-Amino-butanoyl)، -aminobutyric acid، یک مشتق از اسید آمینه است. به دلیل شباهت ساختاری آن به اسیدهای آمینه طبیعی، اغلب در طراحی و سنتز پپتیدها و تقلیدهای پپتید استفاده می شود.

Ac نشان دهنده استیل است. استیلاسیون N ترمینال یک تغییر تثبیت کننده رایج برای پپتیدها در طبیعت است.

Acm

Acm، Acetamidomethyl، می تواند با استفاده از Hg (II) یا Ag (I) حذف شود. این یکی از متداول‌ترین گروه‌های محافظ تیول برای سیستئین در هنگام سنتز پپتیدها با پیوندهای دی سولفیدی است.

ACTH

ACTH (هورمون آدرنوکورتیکوتروپیک) هورمونی است که از هیپوفیز قدامی ترشح می شود و قشر آدرنال را برای تولید کورتیکواستروئید تحریک می کند.

آدا

Aad (L- -aminoadipic acid) یک اسید آمینه غیر پروتئین زا است. ساختار آن شبیه اسید گلوتامیک (Glu) است که دارای یک گروه متیلن اضافی در زنجیره جانبی آن است.

AEA

({0}}آمینواتوکسی)استیک اسید که به نام گلیسین اتیل استر یا گلیسین اتیل آمید نیز شناخته می‌شود، می‌تواند به عنوان فاصله‌دهنده یا پیوند دهنده در سنتز اصلاح پپتید استفاده شود.

Adpoc

1-(1'-adamantyl)-1-متیل اتوکسی کربونیل، یک گروه محافظت کننده آمینو بسیار حساس به اسید در سنتز پپتید، می تواند توسط 3٪ TFA/CH2Cl2 محافظت شود.

آسیا

AFC (7-آمینو-4-تری فلورومتیل کومارین) یک ترکیب فلورسنت با تحریک کومارین آزاد شده در 395-400 نانومتر، انتشار در 495-505 نانومتر است.

تجمیع

گونه های با وزن مولکولی بالاتر به دلیل چسبندگی غیرکووالانسی گونه های کوچکتر تشکیل می شوند. به ویژه در پروتئین ها، تجمع شکلی از دناتوره شدن است که می تواند روی سطوح غیرقطبی با ساختارهای ثانویه رخ دهد، مانند سطوحی که معمولاً فعل و انفعالات درون مولکولی ایجاد می کنند و در مارپیچ ها و ورقه های پروتئین مدفون می شوند. مولکول ها با یکدیگر برهم کنش می کنند و گاهی اشکال چند مولکولی نامحلول را تشکیل می دهند. تجمع در تضاد با الیگومریزاسیون، برهمکنش طبیعی پروتئین های بومی به درستی تا شده برای تشکیل پلیمرهای درجه بالاتر است.

AHX

AHX، آمینو هگزانوئیل،6-آمینو هگزانوئیک اسید، که به اختصار Aca یا LC نیز نامیده می شود، معمولاً به عنوان یک فاصله دهنده کوتاه غیرقطبی بین بیوتین، فلوروفورها و توالی های پپتیدی معرفی می شود.

آیب

2-اسید آمینوایزوبوتیریک یک اسید آمینه غیر پروتئینی کمیاب است که محصول نهایی متابولیسم پیریمیدین است و از طریق ادرار دفع می‌شود و در برخی از آنتی‌بیوتیک‌های قارچی وجود دارد. همچنین برای جایگزینی اسیدهای آمینه طبیعی برای سنتز پپتید استفاده می شود.

الکل ها

الکل ها آن دسته از ترکیبات آلی هستند که با حضور یک، دو یا چند گروه هیدروکسیل (-OH) مشخص می شوند که در یک گروه آلکیل یا زنجیره هیدروکربنی به اتم کربن متصل هستند. الکل های پپتیدی ترکیبات بالینی مهمی هستند که در مطالعات رابطه ساختار-فعالیت (SAR) برای کشف دارو به اندازه کافی مورد بررسی قرار نگرفته اند. به عنوان مثال، DAMGO یک آگونیست گیرنده مواد افیونی است که توسط الکل در ترمینال C، با توالی Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol تغییر یافته است. دارای گزینش پذیری و میل ترکیبی بالایی برای گیرنده μ-اپیوئیدی است.

آلدهید

آلدهید یک ترکیب آلی است که در آن گروه کربونیل به یک اتم کربن در انتهای یک زنجیره کربن متصل است. پپتید آلدئیدها ابزار مهمی در بیوشیمی و بیولوژی شیمیایی برای مهار و از کار انداختن شیمیایی پروتئازها هستند.

الک

آلوک - آلیلوکسی کربونیل، گروه محافظت کننده آمینو (همچنین به اختصار Alloc). حفاظت را می توان با Pd(PPh3)4 حذف کرد.

بیماری آلزایمر

بیماری آلزایمر که با پلاک‌های آمیلوئید و درهم‌تنیدگی‌های تاو مشخص می‌شود، ناشی از اختلال عملکرد سیناپسی و مشکلات مسیر پاکسازی است که باعث اختلال شناختی می‌شود.

Amc

7-آمینو-4-متیل کومارین (AMC) یک کاوشگر فلورسنت رایج برای برچسب زدن پپتید در مطالعات پروتئاز است. ترکیب آن با یک پپتید سیگنال فلورسنت را خاموش می کند، و AMC آزاد شده پس از برش پروتئاز می تواند فعالیت آنزیم را با حداکثر تحریک/انتشار 345/445 نانومتر تعیین کند. به عنوان مثال، پپتید فلورسنت بستر ترجیحی برای تعیین فعالیت شبه تریپسین پروتئازوم خالص شده، با توالی: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

ANP

پپتید ناتریورتیک دهلیزی (ANP)، هورمونی است که توسط دهلیزهای قلب در پاسخ به افزایش حجم و فشار خون تولید و آزاد می شود. عملکرد آن تنظیم تعادل مایعات و فشار خون با افزایش اتساع عروق، افزایش تولید ادرار (ادرار ادرار) و کاهش بازجذب سدیم در کلیه ها است. این اقدامات به مقابله با اثرات فشار خون بالا و اضافه بار مایعات در بدن کمک می کند.

پپتیدهای آنتی ژنیک

پپتیدهای آنتی ژنیک توالی‌های اسید آمینه کوتاهی هستند که از پروتئین‌ها یا سایر مولکول‌های زیستی مشتق شده‌اند که پاسخ ایمنی ارگانیسم را تحریک می‌کنند. این پپتیدها توسط سیستم ایمنی به عنوان خارجی یا خارجی برای بدن شناخته می شوند که منجر به فعال شدن سلول های ایمنی مانند سلول های T و B می شود. پپتیدهای آنتی ژنیک نقش مهمی در پاسخ های ایمنی از جمله تولید آنتی بادی تطبیقی و توسعه حافظه ایمنی دارند. آنها به طور گسترده در ایمونولوژی و توسعه واکسن مورد مطالعه قرار می گیرند زیرا پتانسیل آنها برای تحریک پاسخ های ایمنی خاص در برابر پاتوژن ها یا سلول های غیر طبیعی است.

پپتید شاخه دار نامتقارن

سنتز پپتیدهای نامتقارن با 2، 4 و 8 شاخه را می توان با وارد کردن استراتژیک لیزین، آرژنین یا اسید گلوتامیک در توالی پپتیدی به دست آورد.

دی متیل آرژینین نامتقارن (ADMA)

دی متیل آرژینین نامتقارن (ADMA، Arg(Me)2) یک ترکیب شیمیایی طبیعی و یک مهارکننده درون زا از نیتریک اکسید سنتاز (NOS) است. Fmoc-Arg(Me){2}}OH (نامتقارن) را می توان مستقیماً برای سنتز پپتیدهای حاوی دی متیل آرژینین نامتقارن استفاده کرد.

آوا

5-آمینووالریک اسید، می‌تواند به عنوان فاصله‌دهنده یا پیوند دهنده در سنتز اصلاح پپتید استفاده شود.

بنزیلوکسی متیل

بنزیلوکسی متیل (Bom) یک گروه محافظ ایمیدازول حساس به اسید است که در فرآیند Boc-SPPS برای پپتیدهای حاوی هیستیدین استفاده می شود. بنزیلوکسی متیل پس از درمان با اسید، فرمالدئید بسیار واکنش پذیر تولید می کند. بنابراین، Bom در حضور Cys، متوکسی آمین یا سایر ترکیباتی که با آلدئیدها واکنش می دهند، بهترین شکاف است.

اسید آمینه بتا ()

اسیدهای آمینه دارای گروه آمینه خود به کربن -کربن هستند که دومین اتم کربن دور از گروه کربوکسیل است. فرمول ساختاری کلی اسید آمینه را می توان به صورت: R-CH(NH2)-COOH نشان داد.

BNP

پپتید ناتریورتیک نوع B (BNP)، هورمونی که عمدتاً توسط بطن های قلب در پاسخ به کشش بیش از حد سلول های عضله قلب تولید می شود. نقش مهمی در تنظیم فشار خون و تعادل مایعات دارد، در درجه اول با ترویج اتساع عروق و افزایش دفع سدیم از طریق کلیه ها.

Boc

t-Butyloxycarbonyl (Boc) یک گروه محافظت کننده بسیار اسید-آمینه-آمینه در سنتز پپتید است، می تواند توسط TFA/متیلن کلرید (1:1)، HCl در اتیل استات یا دی اکسان، 98٪ اسید فرمیک شکسته شود.

بی پی او سی

2-(4-بیفنیلیل)ایزوپروپیلوکسی کربونیل (Bpoc) یک گروه محافظت کننده بسیار اسید-آمینه-آمینه در سنتز پپتید است که می‌توان آن را با 1% TFA/متیلن کلرید جدا کرد.

پپتید شاخه ای

پپتیدهایی با 2، 4 و 8 شاخه را می توان با وارد کردن استراتژیک لیزین، آرژنین یا اسید گلوتامیک در توالی پپتیدی به دست آورد.

Bsi

t-Butyldimethylsilyl (TBS یا TBDMS) یک گروه محافظ هیدروکسیل سازگار با Fmoc-SPPS است. نسبت به اسید حساس است و می تواند به طور انتخابی توسط یون های فلوراید جدا شود.

بز - بنزوئیل

بنزوئیل یک گروه آسیل است که اغلب در انتهای N پپتیدها معرفی می شود. قطبیت آن کمتر از استیل (Ac) است و می تواند به عنوان یک تغییر دائمی باشد.

بزل - بنزیل

بنزیل (Bzl) یک باقیمانده آلکیل و یک گروه محافظ زنجیره جانبی است که برای مسدود کردن الکل‌ها (Ser، Thr، Hyp) در سنتز پپتید استفاده می‌شود. می توان آن را با اسیدهای قوی یا هیدروژنولیز کاتالیزوری (مثلاً هیدروژن/Pd) جدا کرد.

CCK

کوله سیستوکینین (CCK) یک هورمون پپتیدی است که توسط مخاط قسمت فوقانی روده تولید می شود و در سیستم عصبی مرکزی یافت می شود. انقباض کیسه صفرا، آزادسازی آنزیم پانکراس را تحریک می کند و بر فرآیندهای مختلف گوارشی تأثیر می گذارد.

سی جی آر پی

پپتید مرتبط با ژن کلسی تونین (CGRP) یک پپتید اسید آمینه 37- مربوط به کلسی تونین، آمیلین و آدرنو مدولین است. به دو شکل -CGRP (CGRP I) و -CGRP (CGRP II) با فعالیت های بیولوژیکی مشابه وجود دارد. CGRP عمدتاً در نورون های حسی و مرکزی یافت می شود و بر عملکرد قلبی عروقی، متابولیسم کلسیم و تون عروق جنینی جفتی تأثیر می گذارد. گیرنده‌های آن با پروتئین G جفت شده‌اند و آدنیلات سیکلاز را فعال می‌کنند و با پروتئین‌های اصلاح‌کننده فعالیت گیرنده (RAMPs) برای ویژگی لیگاند و قاچاق سلولی تعامل دارند.

چا

L-Cyclohexylalanine (Cha) یک آنالوگ اسید آمینه غیر قطبی فنیل آلانین است که در آن حلقه آروماتیک با یک حلقه سیکلوهگزان جایگزین می شود. این جایگزینی امکان مطالعه نقش اسیدهای آمینه آروماتیک در برهمکنش‌هایی مانند برهمکنش‌های π-π را با جایگزینی باقی‌مانده فنیل آلانین با Cha در آزمایش‌ها فراهم می‌کند.

Chg

L- -سیکلوهگزیل گلیسین (Chg) یک اسید آمینه غیرقطبی است که به طور فضایی مانع می شود. به عنوان یک واسطه دارویی مهم عمل می کند و همچنین در محصولات طبیعی یافت می شود.

کلسترول

کلسترول به طور طبیعی توسط کبد و سایر سلول‌های بدن تولید می‌شود، اما می‌تواند از غذاهایی که می‌خوریم، به‌ویژه از محصولات حیوانی مانند گوشت، مرغ، و لبنیات پرچرب نیز تامین شود. کلسترول را می توان برای بهبود فارماکوکینتیک با پپتیدها مرتبط کرد.

سیس - هایپ

سیس هیدروکسی پرولین، استریوایزومر ترانس هیدروکسی پرولین طبیعی.

نقل قول

سیترولین در پروتئین ها در نتیجه یک اصلاح آنزیمی پس از ترجمه باقی مانده های آرژنین وجود دارد.

CMK

CMK یک مهارکننده کیناز RSK2 با قدرت مشابه اما پایداری شیمیایی کمتر از FMK است.

CNP

پپتید ناتریورتیک نوع C (CNP) یک پپتید توسط سلول های اندوتلیال عروقی است که به دلیل اثرات گشاد کنندگی عروق شناخته شده است. شباهت‌های ساختاری و فیزیولوژیکی با پپتیدهای ناتریورتیک دهلیزی و مغزی (ANP و BNP) را نشان می‌دهد.

سی پی جی

L- -Cyclopentylglycyl (Cpg)، یک اسید آمینه غیر قطبی است که به طور فضایی مانع می شود.

ترمینال C

در توالی پپتیدی، آن باقیمانده منحصربه‌فردی که توسط گروه آمینه‌اش به توالی خطی متصل می‌شود، آن را با یک گروه کربوکسی آزاد باقی می‌گذارد. گروه کربوکسیل این باقیمانده می‌تواند دستخوش تغییراتی مانند آمیداسیون یا در مواردی مانند پیروگلوتامات، لاکتامیزاسیون داخلی شود.

Cy3

سیانین 3 یک رنگ سیانین فلورسنت قرمز است که معمولاً توسط یک منبع نور در حدود 558 نانومتر برانگیخته می شود و نور را در حدود 572 نانومتر ساطع می کند.

Cy5

سیانین 5 یک فلوروفور رنگی سیانین است که فلورسانس مادون قرمز نزدیک منتشر می کند که معمولاً توسط یک منبع نور در حدود 646 نانومتر برانگیخته می شود و نور را در حدود 664 نانومتر ساطع می کند.

داب

اسید L-، -Diaminobutyric یک اسید ω-دیامینو است که آنالوگ کوتاه تری از اورنیتین (Orn) و لیزین (Lys) است. با حفاظت مناسب، اسیدهای ω-دیامینو را می توان به طور انتخابی در موقعیت Nω خود تغییر داد یا برای ایجاد پپتیدهای شاخه دار یا دندریمرها ترکیب کرد.

دابسیل

3-(Dimethylaminoazo)benzene-4-کربوکسیلیک اسید، یک کروموفور مرتبط با گروه‌های آمینه است که در کاربردهای بیوشیمی و زیست‌شناسی مولکولی به‌عنوان خاموش‌کننده در انتقال انرژی تشدید فلورسانس (FRET)، به عنوان مثال با EDANS استفاده می‌شود. تحریک DABCYL در 454 نانومتر.

دابسیل

دابسیل،4-دی متیل آمینو بنزن سولفونیل کلرید، یک کروموفور مرتبط با گروه های آمینه که به عنوان خاموش کننده در ترکیب، به عنوان مثال با EDANS استفاده می شود. برانگیختگی دابسیل در 436 نانومتر.

دانسیل

4-Dimethylamino-1-naphthalene-sulfonyl، یک فلوروفور مرتبط با گروه‌های آمینه، تحریک در ۳۴۲ نانومتر، انتشار در ۵۶۲ نانومتر.

دپ

L-، -Diaminopropionic اسید (Dap یا Dpr) یک اسید ω-دیامینو است که آنالوگ کوتاه تری از اسید دی آمینوبوتیریک (Dab)، اورنیتین (Orn) و لیزین (Lys) است. مشتقات اصلاح شده اسیدهای ω-دیامینو را می توان به طور انتخابی در موقعیت Nω خود تغییر داد یا برای ایجاد پپتیدها یا دندریمرهای شاخه دار ترکیب کرد.

Dde

1-(4,{2}}Dimethyl-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)ethyl (Dde) یک گروه محافظ آمینو است که در سنتز پپتید استفاده می‌شود. می توان آن را به طور انتخابی با استفاده از هیدرات 2٪ در دی متیل فرمامید (DMF) شکافت. Nω-Dde امکان حذف خاص Dde از اسیدهای آمینه مانند Dap، Dab، Orn، یا Lys را پس از سنتز پپتید فاز جامد Fmoc (SPPS) فراهم می‌کند و اصلاح روی رزین گروه Nω-آمینه را تسهیل می‌کند.

دی سولفید

پیوندهای دی سولفیدی پیوندهای کووالانسی هستند که بین دو گروه سولفیدریل (-SH) باقی مانده سیستئین در پروتئین ها تشکیل می شوند.

Dmb

2،4-دی متوکسی بنزیل یک گروه محافظ فرمامید حساس به اسید است که برای اصلاح ستون فقرات برگشت پذیر در سنتز پپتید استفاده می شود. آنها در طول سنتز پپتید فاز جامد (SPPS) به عنوان اسید آمینه یا دی پپتید Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH) ترکیب می شوند، جایی که Fmoc از تجمع پپتیدها جلوگیری می کند و در نتیجه باعث افزایش طول کارآمد می شود. Dmb همچنین واکنش‌های چرخه‌سازی را ترویج می‌کند و از تشکیل آسپاراژیمید جلوگیری می‌کند. برخلاف مشتقات Hmb، Dmb در طول فعال سازی، بنزوکسازپین ها را تشکیل نمی دهد.

Dnp - 2،4-دینیتروفنیل

2،4-دینیتروفنیل یک کروموفور است که به گروه‌های آمینه کونژوگه می‌شود و معمولاً به عنوان خاموش کننده در بسترهای انتقال انرژی تشدید فلورسانس (FRET) استفاده می‌شود.

داد

4،4'-Dimethoxydityl، همچنین به عنوان bis-(4-methoxyphenyl)methyl شناخته می شود، یک گروه محافظ کربوکسامید حساس به اسید است که با سنتز پپتید فاز جامد Fmoc (SPPS) سازگار است.

DOPA

DOPA، 3،4-دی هیدروکسی فنیل آلانین، پیش ساز چندین انتقال دهنده عصبی حیاتی، از جمله دوپامین، نوراپی نفرین، و اپی نفرین است.

دهد

(4،7،10-تری کربوکسی متیل-1،4،7،10-تتراآزاسیکلودودسیل)-استیک اسید، با نام اختصاری DOTA، یک شلاتور حلقوی است که معمولاً به انتهای N پپتیدها متصل است. DOTA برچسب زدن پپتیدها را با رادیونوکلئیدهایی مانند 68Ga یا 90Y برای کاربردهای مختلف زیست پزشکی، از جمله تصویربرداری و درمان هدفمند، تسهیل می‌کند.

DPM

دی فنیل متیل (دیتیل)، یک گروه محافظ N-، O-، و S-ناپذیر اسید.

DTPA

دی اتیلن تری آمین پنتا استیک اسید (DTPA) یک عامل کیلاتور مفید برای رادیونوکلئیدها مانند (68)Ga، (99m)Tc و (111)In است که برای تصویربرداری پزشکی هسته ای قابل استفاده هستند.

ادان

5-[(2-Aminoethyl)amino]naphthalene-1-sulfonic acid (EDANS) یک فلوروفور است که معمولاً به Nω اسیدهای آمینه مانند لیزین مرتبط است. اغلب در بسترهای FRET استفاده می شود که معمولاً با کوئنچرهایی مانند DABCYL جفت می شود. EDANS دارای طول موج تحریک 340 نانومتر است و در 490 نانومتر ساطع می کند.

EMAP

پلی پپتید فعال کننده مونوسیت اندوتلیال

و همکاران

اتیل، یک گروه آلکیل و همولوگ متیل (Me)، برای تغییرات دائمی N- و S-اتیلاسیون در پپتیدها استفاده می شود.

نقشه برداری اپی توپ

نقشه برداری اپی توپ (نقشه برداری اپی توپ آنتی ژن) تکنیکی است که برای تعیین نواحی خاص (یعنی اپی توپ های آنتی ژن) روی یک آنتی ژن که توسط آنتی بادی ها یا سیستم ایمنی قابل تشخیص است استفاده می شود. اپی توپ های آنتی ژن را می توان به اپی توپ های خطی و اپی توپ های ساختاری تقسیم کرد. از طریق نقشه برداری اپی توپ آنتی ژن، ما می توانیم عمیقاً رابطه بین ساختار و عملکرد آنتی ژن را درک کنیم که در ساخت واکسن، تشخیص بیماری، ایمونوتراپی و سایر جنبه ها اهمیت زیادی دارد.
برخی از روش های متداول نگاشت اپی توپ آنتی ژن عبارتند از:
کریستالوگرافی اشعه ایکس: می تواند به طور مستقیم ساختار سه بعدی آنتی ژن را تجزیه و تحلیل کند و در نتیجه موقعیت اپی توپ را تعیین کند.
رزونانس مغناطیسی هسته ای: همچنین می توان از آن برای تجزیه و تحلیل ساختار آنتی ژن برای تعیین اپی توپ استفاده کرد.
تکنیک اسکن پپتید: با استفاده از یک سری قطعات پپتید مصنوعی همپوشانی برای شناسایی اپی توپی که به آنتی بادی متصل می شود.
برای مثال، در تحقیق و توسعه واکسن، شفاف سازی اپی توپ های کلیدی روی آنتی ژن به طراحی واکسن های موثرتر و القای پاسخ ایمنی هدفمندتر کمک می کند. در تشخیص بیماری، تعیین اپی توپ های آنتی ژن مربوط به بیماری های خاص می تواند معرف های تشخیصی دقیق تری ایجاد کند.

٪7b٪7b0٪7d٪7dFAM

5-FAM (5-Carboxyfluorescein) یک فلوروفور است که معمولاً برای برچسب‌گذاری مولکول‌های زیستی با طول موج تحریک 490 نانومتر و گسیل در 520 نانومتر استفاده می‌شود.

٪7b٪7b0٪7d٪7dFAM

فلورسئین{0}}کربونیل یک فلوروفور است که به گروه‌های آمینه متصل است، با طول موج تحریک 490 نانومتر و گسیل در 520 نانومتر.

فیتسی

فلورسئین ایزوتیوسیانات (FITC) یک فلوروفور است که با گروه های آمینه واکنش می دهد. هنگام برچسب گذاری یک پپتید در انتهای N با FITC، معمولاً یک فاصله دهنده مانند -آلانین یا Ahx وارد می شود. FITC دارای طول موج تحریک 490 نانومتر و گسیل در 520 نانومتر است.

9-Fluorenylmethyl یک گروه محافظ ناپایدار پایه است که برای محافظت از O و S استفاده می‌شود.

FMK

FMK، فلورومتیل کتون، یک مهار کننده برگشت ناپذیر RSK2 کیناز است.

Fmoc

9-Fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc)، گروه محافظ آمینه در سنتز فاز جامد FMOC، می‌تواند با 20٪ پیپریدین/DMF حذف شود.

برای

فرمیل یک گروه محافظ ایندول است که در Boc-SPPS استفاده می شود. Trp(For) توسط HF در حضور مرکاپتان یا توسط بازهایی مانند پیپریدین شکافته می شود.

عصبانیت

انتقال انرژی تشدید فلورسانس (FRET) انتقال انرژی غیر تابشی از یک فلوروفور (دهنده) برانگیخته شده به یک گیرنده مناسب (کوئنچر) است. انتقال به فاصله، جهت گیری دوقطبی و همپوشانی طیفی دهنده و گیرنده بستگی دارد. در بسترهای FRET، فلوروفور و کوئنچر از طریق یک زنجیره پپتیدی به هم متصل می شوند. برش آنزیمی با جداسازی دهنده و گیرنده فلورسانس را افزایش می دهد.

فلورسانس

فلورسانس نور ساطع شده از ماده ای است که نور یا سایر تشعشعات الکترومغناطیسی را جذب می کند. این زمانی اتفاق می‌افتد که مولکول‌هایی به نام فلوروفورها فوتون‌هایی با طول موج خاص را جذب می‌کنند، برانگیخته می‌شوند و سپس فوتون‌ها ساطع می‌کنند و به حالت پایه خود باز می‌گردند. نور ساطع شده معمولاً دارای طول موج بلندتر و انرژی کمتری نسبت به نور جذب شده است که در نتیجه یک طیف فلورسانس مشخصه ایجاد می شود. این پدیده به طور گسترده برای اهداف مختلف علمی و پزشکی از جمله میکروسکوپ، فلوسیتومتری و طیف‌سنجی فلورسانس استفاده می‌شود.

GIP

پلی پپتید بازدارنده معده (GIP) که به عنوان پپتید انسولینوتروپیک وابسته به گلوکز نیز شناخته می شود، از خانواده هورمون های سکرتین است. ترشح انسولین را تحریک می کند، ترشح اسید معده را مهار می کند و نقش مهمی در تنظیم ترشح انسولین و هموستاز گلوکز دارد.

گلا

L- -اسید کربوکسی گلوتامیک (Gla) از طریق کربوکسیلاسیون پس از ترجمه گلوتامیک اسید تشکیل می‌شود و در نتیجه پروتئین‌هایی مانند استئوکلسین قادر به اتصال یون‌های کلسیم هستند. پپتیدهای حاوی Gla به طور ایده آل با استفاده از سنتز پپتید فاز جامد Fmoc (SPPS) سنتز می شوند، زیرا Gla می تواند برای تولید اسید گلوتامیک در حضور اسیدهای قوی، دکربوکسیلاسیون شود.

GLP

پپتیدهای شبه گلوکاگون اعضایی از ابرخانواده هورمون های پپتیدی گلوکاگون هستند که از ناحیه C ترمینال پروگلوکاگون مشتق شده اند. آنها در درجه اول توسط سلول های L روده سنتز می شوند.

GnRH

هورمون آزادکننده گنادوتروپین (LHRH) یک هورمون دکاپپتیدی است که در سلول‌های ترشحی عصبی هیپوتالاموس تولید می‌شود و به صورت انفجارهای ضربانی در گردش خون پورتال هیپوفیز آزاد می‌شود. ترشح ضربان دار برای عملکردهای تولید مثل، رشد جنسی و تمایز حیاتی است.

GRF

هورمون آزاد کننده هورمون رشد (GHRH) که به نام سوماتورلین نیز شناخته می شود، یک هورمون پپتیدی هیپوتالاموسی است که غده هیپوفیز را برای ترشح و سنتز هورمون رشد تحریک می کند.

Grp

HLA

آنتی ژن لکوسیت انسانی (HLA) به گروهی از پروتئین‌های موجود در سطح سلول‌ها اطلاق می‌شود که نقش مهمی در شناسایی مواد خارجی توسط سیستم ایمنی دارند. آنها توسط ژن های اصلی مجتمع سازگاری بافتی (MHC) در انسان کدگذاری می شوند و برای ارائه آنتی ژن به سلول های T ضروری هستند و سیستم ایمنی را قادر می سازند بین سلول های خود و غیر خود تمایز قائل شود. مولکول های HLA بسیار متنوع و چندشکلی هستند و به طور قابل توجهی به پاسخ های ایمنی فردی و حساسیت به بیماری های خودایمنی و رد پیوند کمک می کنند.

همب

2-هیدروکسی-4-متوکسی بنزیل یک گروه محافظ فرمامید حساس به اسید است که برای اصلاح ستون فقرات برگشت‌پذیر در سنتز پپتید استفاده می‌شود. این به عنوان یک اسید آمینه یا دی پپتید Fmoc-Hmb (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) در طول سنتز پپتید Fmoc فاز جامد (SPPS) گنجانده می شود، از تجمع جلوگیری می کند و باعث گسترش کارآمد پپتید می شود. Hmb همچنین به واکنش های چرخه ای کمک می کند و از تشکیل آسپاراژین جلوگیری می کند.

هار

L-Homoarginine همولوگ L-arginine است که به اختصار Har نامیده می شود و در پلاسما و ادرار یافت می شود. هوموآرژینین نتیجه گوانیداسیون لیزین است که می تواند روی پپتیدها و پروتئین ها نیز انجام شود.

HCI

هوموسیترولین همولوگ ال سیترولین است که به اختصار Hci نامیده می شود و در ادرار انسان قابل تشخیص است.

Hcy

L-homocysteine همولوگ سیستئین است که به اختصار Hcy نامیده می شود و از دمتیلاسیون متیونین تولید می شود. سطح Hcy خون بالا یک عامل خطر برای بیماری های قلبی عروقی و عصبی است. بر خلاف مشتقات Cys، مشتقات Hcy در حین جفت شدن راسمیزه نمی‌شوند و -elimin نیز انجام نمی‌شود.

هله

همولوگ های L-leucine که به اختصار Hle نامیده می شود.

HPH

هموفنیل آلانین، همولوگ فنیل آلانین، که به اختصار Hph نامیده می شود، جزء مهارکننده های ACE و رنین است. Fmoc-Homophe-OH یک داروی ضد التهابی بالقوه است.

Hpr

L-homoproline یا L-picolic acid که به اختصار Pip یا Hpr نامیده می شود. همولوگ پرولین Hpr محصول تخریب ال-لیزین است. هر دو انانتیومر را می توان در پلاسمای انسان تشخیص داد. از آنجایی که باقی مانده های پرولین به شدت بر روی ترکیب پپتید تأثیر می گذارد، جایگزینی Pro با Hpr (یا آزتیدین{3}}کربوکسیلیک اسید (Aze)) می تواند ساختار ثانویه آن را تعدیل کند.

هیپ

L-transhydroxyproline پس از ترجمه توسط اکسیداسیون پرولین تولید می شود. Hyp جزء اصلی کلاژن و پروتئین صدف است.

ایزورین

ایزورین، ایزومر ال سرین، یک اسید آمینه است.

IvDde

ivDde، یک گروه محافظت کننده آمینو، می تواند توسط هیدرات هیدرازین 2٪ در DMF از بین رفته و جدا شود. ivDde نسبت به Dde پایدارتر از درمان های مکرر پیپریدین در طول Fmoc-SPPS است. Nω-ivDde را می توان به طور انتخابی از Dap، Dab Orn، یا Lys حذف کرد، که امکان اصلاح پس سنتتیک روی رزین گروه Nω-amino را فراهم می کند.

KLH

هموسیانین لیمپت سوراخ کلید (KLH) یک متالوپروتئین چند زیر واحدی حامل اکسیژن است که در همولنف هموسیانین غول پیکر لیمپت سوراخ کلید یافت می شود. به عنوان یک حامل آنتی ژن، KLH معمولاً با جفت کردن توالی های پلی پپتیدی هدف، ایمنی زایی و قابلیت های تثبیت آنتی ژن را افزایش می دهد و به طور قابل توجهی تولید آنتی بادی های کارآمد، اختصاصی و کاربردی را ارتقا می دهد.

LHRH

هورمون آزاد کننده هورمون لوتئین کننده (LHRH یا GnRH) یک هورمون دکاپپتیدی است که توسط سلول های ترشح کننده عصبی در هیپوتالاموس سنتز شده و به صورت ضربانی در گردش خون پورتال هیپوفیز آزاد می شود. ترشح ضربان دار برای عملکرد تولید مثل، رشد جنسی و تمایز حیاتی است.

پیوند دهنده

در طراحی و سنتز پپتید، محققین می توانند پیوندی بین بیوتین یا فلورسنت و پپتیدها وارد کنند. یک اسپیسر آبگریز رایج آمینو هگزانوئیک اسید (Ahx) و یک اسپیسر آبدوست معمولی پلی (اتیلن) گلیکول (PEG) است.

لیوفیلیز شده

فرآیند خشک کردن انجمادی، که مایع را از مواد حساس به حرارت حذف می کند. مواد منجمد شده، تحت خلاء زیاد قرار می گیرند و در دمای پایین نگهداری می شوند. فشار ایجاد شده توسط خلاء باعث می شود یخ بدون عبور از حالت مایع از حالت جامد به گاز تبدیل شود. پپتیدها معمولاً به صورت پودر لیوفیلیزه تحویل داده می شوند.

ال سی - ام اس

کروماتوگرافی مایع - طیف سنجی جرمی یک تکنیک تحلیلی همه کاره است که کروماتوگرافی مایع را با طیف سنجی جرمی ادغام می کند تا اطلاعات دقیقی در مورد ترکیب و ساختار مولکول ها در نمونه های پیچیده ارائه دهد.

نقشه ها

پپتیدهای آنتی ژنیک متعدد پپتید آنتی ژنی چندگانه یک راه قوی برای تولید آنتی بادی های ضد پپتیدی با عیار بالا و واکسن های پپتیدی مصنوعی است.

مالدی-ام اس

طیف سنجی جرمی واجذب/یونیزاسیون لیزری به کمک ماتریس (MALDI-MS) یک تکنیک تحلیلی است که برای اندازه گیری نسبت جرم به بار یون ها استفاده می شود. این به ویژه برای تجزیه و تحلیل مولکول های زیستی مانند پپتیدها، پروتئین ها و پلیمرها مفید است.

طیف سنجی جرمی

طیف سنجی جرمی (MS) یک تکنیک تحلیلی قدرتمند است که برای اندازه گیری نسبت جرم به بار (m/z) یون ها استفاده می شود.

4 متر NA

4-متوکسی- -نفتیل آمید، به اختصار MNA، یک فلوروفور است که معمولاً به یک بستر کربوکسی پپتیداز در انتهای C متصل می‌شود. 4M NA قطع شده در 335-350 نانومتر برانگیخته می‌شود و در 410-440 نانومتر ساطع می‌کند.

مگابایت

متوکسی بنزن سولفونیل (Mbs) یک گروه محافظ گوانیدیل است که در سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Boc (Boc-SPPS) استفاده می شود. این گروه محافظ را می توان با برش با هیدروژن فلوراید (HF) از بین برد.

Mbzl

4-متیل بنزیل (Mbzl) یک گروه محافظ سولفیدریل است که در سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Boc (Boc-SPPS) استفاده می‌شود. Mbzl تحت تیمارهای مکرر تری فلورواستیک اسید (TFA) پایدارتر از متوکسی بنزیل (Mob) است و می توان با برش هیدروژن فلوراید (HF) آن را حذف کرد.

مکا

(7-متوکسی کومارین-4-ایل) استیک اسید (Mca) یک فلوروفور است که می تواند به یک گروه آمینه مرتبط شود.
مکا برای بسترهای انتقال انرژی تشدید فلورسانس (FRET) به دینیتروفنیل (Dnp) متصل می شود. طول موج تحریک 325 نانومتر و طول موج انتشار 392 نانومتر است.

MCH

هورمون متمرکز کننده ملانین (MCH) یک نوروپپتید حلقوی است که ابتدا از ماهی و موش جدا شده است. MCH در درجه اول در تنظیم رنگدانه پوست در ماهیان استخوانی و رفتار تغذیه در پستانداران نقش دارد.

من

متیل، ساده ترین جایگزین آلکیل، در N-، O-، و S-متیلاسیون دخیل است که تغییرات دائمی پپتید را تشکیل می دهند.

MeOSuc

3-متوکسی سوکسینیل، مربوط به Asp(OMe) دآمینه شده، یک گروه مسدودکننده N ترمینال قطبی است که معمولاً در بسترهای کربوکسی پپتیداز ترکیب می‌شود.

متیلاسیون

متیلاسیون یک اصلاح پس از ترجمه (PTM) از پپتیدها و پروتئین ها است که در آن یک گروه متیل (-CH3) به طور آنزیمی به باقی مانده های اسید آمینه خاص، معمولاً لیزین (Lys)، آرژنین (Arg)، هیستیدین (His) یا گلوتامات (His) اضافه می شود. گلو). این اصلاح می تواند به طور قابل توجهی بر عملکرد پروتئین، پایداری و برهمکنش با سایر مولکول ها تأثیر بگذارد و در نتیجه نقش های محوری در تنظیم فرآیندهای سلولی متنوع از جمله بیان ژن، انتقال سیگنال و برهمکنش های پروتئین-پروتئین ایفا کند.

MHC

مجتمع اصلی سازگاری بافتی (MHC) یک منطقه ژنتیکی حاوی ژن هایی است که مولکول های MHC را رمزگذاری می کنند. این مولکول ها نقش مهمی در سیستم ایمنی و خودایمنی دارند. در انسان، این مجموعه به عنوان سیستم آنتی ژن لکوسیت انسانی (HLA) نیز شناخته می شود.

MHC I

مولکول‌های MHC کلاس I (MHC I) پروتئین‌هایی روی سطوح سلولی هستند که پپتیدها را از داخل سلول به سلول‌های T سیتوتوکسیک ارائه می‌کنند. این به سلول‌های ایمنی کمک می‌کند تا سلول‌های عفونی یا غیرطبیعی را شناسایی کرده و از بین ببرند، که برای دفاع ایمنی در برابر عوامل بیماری‌زا و سرطان بسیار مهم است.

MHC II

مولکول های MHC کلاس II (MHC II) پروتئین های سطح سلولی هستند که پپتیدهای مشتق شده از مواد خارجی را به سلول های T کمکی ارائه می کنند. این تعامل برای هماهنگی پاسخ های ایمنی و فعال کردن سایر سلول های ایمنی در برابر پاتوژن ها ضروری است.

آرژنین مونو متیلاسیون

آرژنین مونو متیله (MMA) یک اصلاح پس از ترجمه است که در آن یک گروه متیل منفرد (-CH3) به طور آنزیمی به نیتروژن گوانیدینی باقیمانده آرژنین در یک پپتید یا پروتئین اضافه می شود.

مگاپاسکال

3-مرکاپتوپروپیلامین، می‌تواند به عنوان لیگاند پپتیدی یا اصلاح‌کننده در کاربردهای مختلف بیوشیمیایی و بیوپزشکی استفاده شود.

من

Myristoylation یک فرآیند اصلاح چربی است که در آن یک گروه myristoyl، متشکل از یک اسید چرب اشباع شده با کربن، به صورت کووالانسی به انتهای N پپتید متصل می شود. این اصلاح برای لنگر انداختن پروتئین به غشای سلولی، تسهیل محلی سازی و مشارکت آن در فرآیندهای سلولی متنوع عمل می کند.

1-نال

-(1-نفتیل)-ال-آلانین یک مشتق اسید آمینه غیرقطبی شبیه فنیل آلانین است، اما به جای گروه فنیل، یک گروه نفتیل دارد.

2-نال

-(2-نفتیل)آلانین یک مشتق اسید آمینه غیرقطبی شبیه فنیل آلانین است، اما به جای گروه فنیل دارای یک گروه نفتیل است.

NBD

3-نیتروبنز-2-oxa-1، 3-دیازول (NBD) معمولاً با کونژوگه کردن معرف NBD-Cl به پپتید وارد می‌شود. پپتیدهای نشاندار شده با NBD به طور گسترده برای کاربرد آنها در مطالعات متمرکز بر غشاها و زیست شناسی سلولی انتخاب می شوند.

NHEt

N-Ethylamide را می توان به عنوان شکل دکربوکسیله آلانین C ترمینال در نظر گرفت. در بوزرلین آگونیست LHRH، NHEt به عنوان آنالوگ گلیسینامید C ترمینال عمل می کند. پپتید N-ethylamide در برابر تجزیه توسط کربوکسی پپتیدازها مقاوم است.

Nle

ال-نورلوسین (Nle) ایزوستر پایدار L-متیونین است. هنگامی که فعالیت بیولوژیکی یک پپتید به دلیل تشکیل سولفوکسید به خطر بیفتد، Nle را می توان بدون تغییر رفتار عملکردی آن جایگزین Met کرد.

نوتا

NOTA, 1,4,7-triazacyclononane-1,4,7-تری استیک اسید یک شلاتور دو عملکردی است که به عنوان چارچوبی برای ساخت ابزارهای تصویربرداری PET عمل می‌کند. همچنین در طراحی پروب و تقویت سیگنال از طریق اثرات چند ظرفیتی مورد استفاده قرار می گیرد و کاربردهای بالقوه ای را به عنوان یک رادیودارو گالیوم تشخیصی دارد.

ن-من

N-Me معمولاً به N-متیلاسیون اشاره دارد، یک اصلاح شیمیایی که در آن یک گروه متیل (-CH 3) به یک اتم نیتروژن در مولکول، مانند N-Me-Gly، N-Me-Ser، N-Me متصل می شود. -Tyr، N-Me-Thr، N-Me-Asp، N-Me-Glu، N-Me-Ala، N-Me-Phe، N-Me-Leu، N-Me-Ile، N-Me -Val ، N-Me-Met، N-Me-Nle، N-Me-Nva، و غیره.

نوداگا

NODAGA،1،4،7-تریازاسیکلونونان،1-اسید گلوتاریک-4،7-اسید دی استیک، یک شلاتور دو عملکردی برجسته برای طراحی و توسعه رادیوداروهای آلی فلزی است که قابل توجه است. پتانسیل برای کاربرد در تصویربرداری تشخیصی و رادیوتراپی هدفمند.

ان پی ایس

2-نیتروفنیل تیو (Nps) یک گروه محافظ S است که در سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Boc (Boc-SPPS) استفاده می‌شود. می‌توان آن را توسط تیول‌ها، به‌ویژه از طریق گروه سولفیدریل آزاد سیستئین (Cys) جدا کرد که منجر به تشکیل همزمان پیوند دی سولفیدی می‌شود.

NPY

نوروپپتید Y (NPY) یک نوروپپتید برجسته در مغز و بخشی از خانواده نوروپپتید Y است که شامل پلی پپتید پانکراس (PP) و پپتید YY (PYY) است.

Npys

2-Nitro-2-pyridylsulfenyl (Npys) یک گروه محافظ S است که با سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Boc (Boc-SPPS) سازگار است. Npys را می‌توان توسط تیول‌ها، به‌ویژه از طریق گروه سولفیدریل آزاد سیستئین (Cys) جدا کرد و در نتیجه پیوند دی سولفیدی به‌طور همزمان تشکیل شد.

نوا

نوروالین یک اسید آمینه آلیفاتیک غیرقطبی و همولوگ اسید آمینوبوتیریک (Abu) است.

-نفتیل آمید یک فلوروفور است که معمولاً در بسترهای کربوکسی پپتیداز استفاده می شود و معمولاً در انتهای C پپتیدها به هم متصل می شود. NA شکافته شده در 330 نانومتر برانگیخته می شود و در 370 نانومتر ساطع می کند.

-نفتیل آمید یک فلوروفور است که معمولاً در بسترهای کربوکسی پپتیداز استفاده می شود و معمولاً در انتهای C پپتیدها به هم متصل می شود. شکاف NA در 320-340 نانومتر، انتشار در 410-420 نانومتر.

OAll

آلیل استر یک گروه محافظ کربوکسیل است که با سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Fmoc و Boc (SPPS) سازگار است. مشابه آلوک، استرهای آلیل را می توان به طور انتخابی با تیمار Pd(PPh3)4 حذف کرد. در Fmoc-SPPS، Asp (OAll) مستعد تشکیل آسپارتیمید با کاتالیز پایه است.

OBzl

بنزیل استر، یک گروه محافظ کربوکسیل، می تواند با هیدروژناسیون کاتالیزوری (مانند H2/Pd) یا اسیدهای قوی حذف شود.

OcHex

OcHex یک گروه محافظ کربوکسیل استاندارد است که در سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Boc (Boc-SPPS) استفاده می شود.

ODmab

4-(N-[1(4،4-دی متیل-2،6-دیوکسوسیکلوهگزیلیدن)-3-اتیل بوتیل]آمینو) بنزیل استر (ODmab) یک محافظ کربوکسیل است گروه مورد استفاده در سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Fmoc (Fmoc-SPPS). می توان آن را با استفاده از هیدرات 2٪ در DMF شکافت و از بین برد.

ODmb

2،4-دی متوکسی بنزیل استر یک گروه محافظ کربوکسیل بسیار حساس به اسید است که می تواند با استفاده از 1٪ TFA در دی کلرومتان حذف شود.

OEt

اتیل استر، با توجه به شرایط سخت مورد نیاز برای حذف اتیل استرها، اصلاح پپتیدها با اتیل استرها می تواند چربی دوستی و پایداری آنها را افزایش دهد.

OFm

9-فلورنیل متیل استر یک گروه محافظ کربوکسیل ناپایدار پایه است که می‌تواند با استفاده از پیپریدین در DMF حذف شود.

OHex

هگزیل استرها، با توجه به شرایط سخت مورد نیاز برای حذف اتیل استرها، اصلاح پپتیدها با اتیل استرها می تواند چربی دوستی و پایداری آنها را افزایش دهد.

سازمان همکاری اسلامی

L-Otahydroindole{1}}کربوکسیلیک اسید (Oic) یک اسید آمینه غیرقطبی است. قرار دادن این اسید آمینه مرتبط با پرولین در توالی پلی پپتیدی به شدت بر روی ترکیب پپتید تأثیر می گذارد.

OMe

متیل استرها گروه های نیمه دائمی محافظ C ترمینال در سنتز فاز مایع هستند و می توانند به هیدرازیدهای پپتیدی، پیش سازهای پپتید آزیدهای فعال تبدیل شوند. کوپلینگ آزیدی محبوب ترین روش جفت قطعه در سنتز پپتید فاز مایع است.

OMpe

3-Methylpent-3-yl ester (OMpe) یک گروه محافظ کربوکسیل حساس به اسید است که اغلب برای محافظت از گروه کربوکسیل اسید آسپارتیک (Asp) در سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Fmoc (Fmoc-SPPS) استفاده می‌شود. این آنالوگ ترت بوتیل استر که به صورت استریکی بیشتر نیاز دارد، به طور خاص برای کاهش تشکیل آسپاراژیمید کاتالیز شده با پایه توسعه داده شد.

ONp

استرهای ارتو نیتروفنیل اسیدهای آمینه Boc یا Z مشتقات از پیش فعال شده ای هستند که در سنتز محلول پپتیدی استفاده می شوند.

اورن

اورنیتین (Orn) از آرژنین در طول چرخه اوره تولید می شود و همچنین می تواند در پپتیدها به عنوان یک محصول تجزیه آرژنین مشاهده شود. تشکیل Orn از طریق آسیلاسیون قسمت گوانیدین آرژنین یک واکنش جانبی رایج در سنتز پپتید است.

سیستم عامل

استر هیدروکسی سوکسینیمید (OSu، به اختصار NHS) یک مشتق اسید آمینه از پیش فعال شده است که معمولا در سنتز پپتید، به ویژه اصلاح پپتید استفاده می شود. استرهای OSu ایمن، غیر استریک، سازگار با سیستم های آبی هستند و به راحتی قابل حمل هستند.

OtBu - استر t-Butyl

ترت بوتیل استر، یک گروه کربوکسیل حساس به اسید برای اسیدهای آمینه در سنتز پپتید.

پابا

4-آمینوبنزوئیک اسید (پارامینوبنزوئیک اسید)، می تواند برای سنتز پیوند دهنده های مزدوج آنتی بادی-دارو استفاده شود. به عنوان مثال، Mal-PEG2-Val-Cit-PABA یک پیوند دهنده آنتی بادی دارویی مزدوج (ADC) قابل تجزیه است.

Pabc

PABC (پارا آمینوبنزیل کاربامات) یک ترکیب شیمیایی است که در سنتز ترکیبات آنتی بادی-دارو (ADCs) به عنوان پیوند دهنده استفاده می شود. اتصال داروها به آنتی‌بادی‌ها را به شیوه‌ای کنترل‌شده تسهیل می‌کند و امکان تحویل هدفمند دارو در درمان‌های سرطان و سایر کاربردهای پزشکی را فراهم می‌کند. به عنوان مثال، Mc-Val-Cit-PABC-PNP یک پیوند دهنده قابل شکافت با کاتپسین است که در ترکیبات آنتی بادی-دارو (ADCs) استفاده می شود.

PACAP

پلی پپتید فعال کننده آدنیلات سیکلاز هیپوفیز (PACAP) یک نوروپپتید بسیار حفاظت شده است که به طور برجسته در سراسر مغز پستانداران بیان می شود. اثرات بیولوژیکی خود را با افزایش سطح AMP حلقوی درون سلولی از طریق تعامل گیرنده اعمال می کند.

پم

پالمیتول، یک گروه آسیل غیرقطبی است که در انتهای N یا سمت آن معرفی شده است. پالمیتویلاسیون نیز به عنوان یک اصلاح پس از ترجمه پروتئین ها مشاهده شده است.

PAM

رزین متیل فنیل استامید رزینی است که به طور خاص برای سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Boc (Boc-SPPS) طراحی شده است. پپتیدهای سنتز شده روی این رزین را می توان با استفاده از برش HF آزاد کرد.

بار

در ترکیبات آنتی بادی-دارو (ADCs)، پیوند دهنده آنتی بادی را به بار سیتوتوکسیک متصل می کند. انتخاب محموله بسیار مهم است زیرا اثربخشی و ویژگی ADCها را در ارائه درمان به بافت‌های هدف از طریق مکانیسم‌های آزادسازی خاص تعیین می‌کند.

سرب

2،2،4،6،7-پنتامتیل دی هیدروبنزوفوران-5- سولفونیل (Pbf) گروه محافظ گوانیدینو ترجیحی است که در سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Fmoc (Fmoc-SPPS) استفاده می‌شود. در مقایسه با Pmc مقاومت اسیدی کمی بالاتر از خود نشان می دهد.

قلم

پنی‌سیلامین آنالوگ L-سیستئین است که با جایگزینی یک گروه متیل (-CH3) با یک اسید کربوکسیلیک (-COOH) مشخص می‌شود.

خودآرایی پپتید

خودآرایی پپتید زمانی است که پپتیدها به طور طبیعی خود را در ساختارهای منظم بدون دخالت خارجی مرتب می کنند. این فرآیند توسط فعل و انفعالات غیرکووالانسی مانند پیوند هیدروژنی، برهمکنش های آبگریز، نیروهای الکترواستاتیکی و انباشتگی π-π هدایت می شود. خودآرایی پپتید می تواند منجر به تشکیل نانوساختارهای مختلف از جمله الیاف، کره، ورقه ها و ژل ها شود که در علم مواد، بیوتکنولوژی و پزشکی کاربرد دارند.

فنیلاک

فنیل استیل (Phenylac یا Phac) یک گروه آسیلی است که معمولاً در انتهای N پپتیدها به هم متصل می‌شوند که با قطبیت کمتر در مقایسه با استیل (Ac) مشخص می‌شود. این یک اصلاح دائمی از پپتیدها است.

دکترای پی

فنیل گلیسین (Phg) یک مشتق اسید آمینه است که در آن یک گروه فنیل جایگزین اتم هیدروژن در مولکول گلیسین می شود.

فی

پپتید هیستیدین ایزولوسین (PHI)، یک پپتید خوک مربوط به VIP و سکرتین است.

پی اچ ام

پپتید هیستیدین متیونین (PHM)، یک پپتید انسانی مرتبط با VIP.

نقطه ایزوالکتریک (pI) به عنوان سطح pH که در آن پروتئین/پپتید دارای بار خالص صفر است (اسمولوچ و همکاران، 2016) تعریف می شود.

پی ام سی

2،2،5،7،8-پنت متیل کرومان-6- سولفونیل (Pmc) یک گروه محافظ گوانیدینیل است که معمولاً در سنتز پپتید فاز جامد مبتنی بر Fmoc (Fmoc-SPPS) استفاده می‌شود. نسبت به Pbf کمی کمتر حساس به اسید است.

پنا

p-Nitroaniline، یک کروموفور، به طور معمول به C-پایانه سوبستراهای کربوکسی پپتیداز کونژوگه می شود. جذب p-nitroaniline آزاد شده معمولاً در طول موج های حدود 405 یا 410 نانومتر اندازه گیری می شود.

پرا

L-Propargylglycine (Pra) توسط میکروارگانیسم ها تولید می شود. این اسید آمینه، که با ساختار پیوند سه گانه آن مشخص می شود، به عنوان یک واحد پایه برای سنتز پپتیدهایی که قادر به درگیر شدن در واکنش های "شیمی کلیکی" هستند، بسیار مورد توجه قرار می گیرد و توجه قابل توجهی را در این زمینه به خود جلب می کند.

Pth

هورمون پاراتیروئید (PTH) یک هورمون پپتیدی است که توسط غدد پاراتیروئید ترشح می شود و برای حفظ هموستاز کلسیم و فسفر در مایع خارج سلولی ضروری است.

PTM ها

تغییرات پس از ترجمه (PTMs) پروتئین‌ها، گروه‌ها یا پروتئین‌های عملکردی را اضافه می‌کنند، زیرواحدهای تنظیمی را قطع می‌کنند یا کل پروتئین‌ها را تجزیه می‌کنند. این تغییرات مانند فسفوریلاسیون، گلیکوزیلاسیون، متیلاسیون، استیلاسیون، لیپیداسیون، یوبی کوئیتیناسیون، نیتروزیلاسیون و پروتئولیز بر نحوه عملکرد طبیعی سلول ها و در طول بیماری تأثیر می گذارد. درک PTM ها برای تحقیقات پایه و یافتن درمان های جدید بسیار مهم است.

پیر

اسید پیروگلوتامیک که با اختصاراتی مانند Pgl، Glp، pGlu یا

فنیلازوبنزیل متوکسی کربونیل یک گروه N-حفاظ کننده کروموفوریک است که در سنتز پپتید استفاده می شود و با هیدروژناسیون کاتالیزوری یا اسید قوی قابل تجزیه است. حداکثر طول موج جذب در 229 نانومتر، 320 نانومتر و 441 نانومتر را نشان می‌دهد.

جفت خاموش کننده

یک جفت کوئنچر شامل یک مولکول فلورسنت (فلوروفور) و یک مولکول خاموش کننده است که در تحقیقات و سنجش های مبتنی بر فلورسانس استفاده می شود. کوئنچر نور ساطع شده توسط فلوروفور را جذب می کند و فلورسانس آن را کاهش می دهد. هنگامی که فلوروفور و خاموش کننده از هم جدا می شوند، مانند یک واکنش بیوشیمیایی، سیگنال فلورسانس افزایش می یابد. این به محققان اجازه می دهد تا تغییرات و تعاملات را در زمان واقعی اندازه گیری کنند. این تکنیک معمولاً در کاربردهایی مانند PCR بلادرنگ، پروب‌های مولکولی و سنجش FRET (انتقال انرژی تشدید فورستر) استفاده می‌شود.

رادیو لیگاندها

فلوئور{0}} یک رادیو لیگاند است که معمولاً در تصویربرداری PET برای ارزیابی متابولیسم گلوکز در بافت ها استفاده می شود و معمولاً در تشخیص سرطان و تصویربرداری مغز استفاده می شود.

کتابخانه پپتیدی تصادفی

یک کتابخانه پپتیدی تصادفی مجموعه‌ای از توالی‌های پپتیدی کوتاه است که به‌طور تصادفی تولید می‌شوند. هر پپتید در کتابخانه دارای تعداد خاصی از اسیدهای آمینه با توالی های تصادفی تعیین شده است که طیف متنوعی از مولکول های پپتید را ایجاد می کند. محققان از این کتابخانه ها برای غربالگری پپتیدهایی با خواص خاص، فعالیت های بیولوژیکی یا برهمکنش با مولکول های هدف استفاده می کنند. آنها به ویژه در کشف دارو، ایمونولوژی و مطالعات برهمکنش های پروتئین-پروتئین مفید هستند و به شناسایی درمان های جدید و درک فرآیندهای بیولوژیکی پیچیده کمک می کنند.

باقیمانده (ها)

باقیمانده یک اسید آمینه مجزا در یک پپتید یا پروتئین است. از آنجایی که آمینو اسیدها از طریق پیوندهای پپتیدی به یکدیگر می پیوندند و این زنجیره ها را تشکیل می دهند، هر واحد اسید آمینه باقیمانده نامیده می شود. این اصطلاح به این دلیل استفاده می شود که در طول تشکیل پیوند پپتیدی، هر اسید آمینه یک مولکول آب (H2O) را از دست می دهد و چیزی را که به عنوان باقی مانده از آن یاد می شود، باقی می گذارد.

رزین

رزین یک پلیمر نامحلول است که در سنتز پپتید فاز جامد (SPPS) به عنوان یک تکیه گاه جامد برای افزودن مداوم اسیدهای آمینه استفاده می شود. دانه های رزین سطحی پایدار و بی اثر را فراهم می کنند که اسیدهای آمینه اولیه به صورت کووالانسی به آن متصل می شوند و به زنجیره پپتیدی اجازه می دهند که باقی مانده به باقی مانده ساخته شود.

رودامین بی

رودامین B یک رنگ صورتی روشن تا قرمز با طول موج تحریک معمولاً حدود 540-570 نانومتر و محدوده نور ساطع شده 560-580 نانومتر است. معمولاً از طریق گروه آمینه N ترمینال پپتید به دنباله پپتیدی کونژوگه می شود.

RP-HPLC

کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا فاز معکوس.

SAR

داروهای رابطه ساختار-فعالیت (SAR) با مطالعه رابطه بین ساختار شیمیایی دارو و فعالیت بیولوژیکی آن ایجاد می‌شوند.

سر

سارکوزین، ساده ترین اسید آمینه N-الکیله شده.

SDMA

دی متیل آرژینین متقارن (SDMA، Arg(Me)2)، Fmoc-Arg(Me)2-OH (متقارن) می تواند به طور مستقیم برای سنتز پپتیدهای حاوی دی متیل آرژینین متقارن استفاده شود.

SPPS

سنتز پپتید فاز جامد (SPPS) روشی برای سنتز شیمیایی پپتیدها است که در آن پپتیدها با افزودن متوالی اسیدهای آمینه محافظت شده به صورت مرحله‌ای روی یک تکیه‌گاه یا رزین جامد مونتاژ می‌شوند. SPPS شامل دو استراتژی است: Fmoc-SPPS و Boc-SPPS، که در انتخاب گروه های محافظ گروه N-amino (Fmoc یا Boc) و گروه های محافظ زنجیره جانبی متفاوت هستند. نوع گروه محافظ N-amino انتخاب شده، استراتژی حفاظت از زنجیره جانبی و شرایط جداسازی نهایی پپتید از رزین را تعیین می کند.

استا

استاتین که به اختصار Sta نامیده می شود، یک اسید آمینه غیر پروتئینی است که اغلب در طراحی شبیه سازهای پپتیدی، به ویژه در سنتز مهارکننده های پروتئاز استفاده می شود.

استبو

Tert-Butylthio (StBu) یک گروه محافظ S است که با احیای فسفین جدا می شود و با Boc-SPPS سازگار است.

موفق

سوکسینیل یک اصلاح ترمینال N قطبی است که مربوط به آسپارتات دآمینه شده است و معمولاً در بسترهای کربوکسی پپتیداز گنجانده می شود.

تامرا

TAMRA که به اختصار TMR نیز نامیده می شود، یک فلوروفور است که می تواند به یک گروه آمینه متصل شود. اغلب در ترکیب با FAM برای بسترهای FRET استفاده می شود. TAMRA دارای طول موج تحریک 485 نانومتر و طول موج انتشار 535 نانومتر است.

tBu

ترت بوتیل یک گروه محافظ اسیدی است که معمولاً برای الکل‌ها و فنل‌ها استفاده می‌شود و می‌توان با استفاده از اسید تری فلورواستیک (TFA) آن را جدا کرد.

چاله

تری اتیل آمونیوم فسفات بافری است که در فازهای متحرک HPLC فاز معکوس استفاده می شود.

TFA

اسید تری فلورواستیک (TFA) برای برش پپتید از رزین در Fmoc-SPPS و برای حذف گروه‌های محافظ مشتق از tBu استفاده شد.

TFMSA

اسید تری فلورومتان سولفونیک (TFMSA) یک اسید قوی تر از TFA است. TFMSA می تواند به عنوان جایگزین ایمن تر برای HF بسیار سمی برای مرحله برش نهایی استراتژی Boc-SPPS استفاده شود.

Tle

L-tert-leucine (Tle) یک اسید آمینه غیرقطبی با زنجیره‌های جانبی غیرقطبی است که مارپیچ‌ها را بی‌ثبات می‌کند.

تموب

2،4،6-Trimethoxybenzyl یک گروه محافظ Asn و Gln آمید حساس به اسید است که در Fmoc-SPPS استفاده می شود.

Tos

Tosyl به عنوان یک گروه محافظ برای گوانیدین و ایمیدازول در Boc-SPPS استفاده می شود و می تواند توسط Na/NH3 حذف شود.

Trt

Trityl (Trt) یک گروه محافظ اسیدی است که برای Asn، Cys، Gln و باقیمانده‌های His در Fmoc-SPPS استفاده می‌شود. می توان آن را به طور انتخابی با استفاده از تری فلورواستیک اسید (TFA) حذف کرد.

پودر لیوفیلیزه سفید

پپتیدهای خالص معمولاً پس از خشک کردن انجمادی در حالت پودر سفید وجود دارند.

Vip

پپتید وازواکتیو روده ای (VIP) یک پپتید اسید آمینه 28- متعلق به ابرخانواده پپتید گلوکاگون-گرلین-سکرتین است.

زان

9-Xanthydryl (Xan) یک گروه محافظ آمید حساس به اسید است که برای باقی مانده‌های Asn و Gln در Boc-SPPS استفاده می‌شود. Xan را می توان به صورت انتخابی با استفاده از TFA حذف کرد.

پودر لیوفیلیزه زرد

هنگامی که پپتید با فلورسین FAM نشاندار می شود، پودر لیوفیلیزه معمولاً ظاهری زرد نشان می دهد.

Z-benzyloxycarbonyl که به اختصار Z یا Cbz نامیده می شود، به عنوان یک گروه محافظ آمینو در سنتز پپتید استفاده می شود. می توان آن را با استفاده از هیدروژنولیز یا اسیدهای قوی به عنوان HF تمیز یا HBr/استیک اسید حذف کرد.

واژه نامه

تلفن

آدرس

ایمیل

واژه نامه