پس از درک دلایل بی ثباتی پپتید، بر اساس سال ها تجربه در سنتز پپتید تایید شد که راه حل های زیر برای بهبود پایداری پپتید وجود دارد.
1) جهش به سمت سایت
جایگزینی باقی مانده هایی که باعث بی ثباتی پپتید می شوند یا معرفی باقی مانده هایی که پایداری پپتید را از طریق مهندسی ژنتیک افزایش می دهند، می تواند پایداری پپتید را بهبود بخشد.
2) اصلاح شیمیایی
روشهای اصلاح شیمیایی زیادی برای پپتیدها وجود دارد که اصلاح PEG بیشتر مورد مطالعه قرار گرفته است. PEG یک ترکیب پلیمری محلول در آب است که زیست تخریب پذیر و غیرسمی در داخل بدن است. PEG می تواند حلالیت پپتیدها را پس از اتصال بهبود بخشد، زیست سازگاری را تنظیم کند، پایداری حرارتی را افزایش دهد، در برابر تخریب پروتئاز مقاومت کند، آنتی ژن را کاهش دهد و نیمه عمر را در داخل بدن افزایش دهد. انتخاب روشهای اصلاح مناسب و کنترل درجه اصلاح میتواند آمادگی جسمانی را بهبود بخشد یا فعالیت بیولوژیکی اولیه را افزایش دهد.
3) مواد افزودنی
با افزودن مواد افزودنی مانند قندها، پلی ال ها، ژلاتین، اسیدهای آمینه و نمک های خاص می توان پایداری پپتیدها را بهبود بخشید. قند و پلیالها مولکولهای آب بیشتری را مجبور میکنند تا پروتئینها را در غلظتهای پایین احاطه کنند و در نتیجه پایداری پپتیدها را بهبود میبخشند. در طول فرآیند خشک کردن انجمادی، مواد ذکر شده در بالا می توانند جایگزین آب و تشکیل پیوندهای هیدروژنی با پپتیدها برای تثبیت ساختار طبیعی آنها شوند و همچنین می توانند دمای انتقال شیشه ای محصولات یخ زده را افزایش دهند. علاوه بر این، سورفکتانت هایی مانند SDS، Tween، Pluronic می توانند از جذب سطحی پپتید، تجمع و رسوب جلوگیری کنند.
4) خشک کردن انجمادی
مجموعه ای از واکنش های شیمیایی که در پپتیدها رخ می دهد، مانند دآمیداسیون، حذف بتا، هیدرولیز و غیره، نیاز به مشارکت آب دارد که می تواند به عنوان فاز متحرک برای سایر واکنش دهنده ها نیز عمل کند. علاوه بر این، کاهش محتوای آب می تواند دمای دناتوره شدن پپتیدها را افزایش دهد. بنابراین، خشک کردن انجمادی می تواند پایداری پپتیدها را بهبود بخشد.