تعامل بین پروتئین ها و کربوهیدرات ها نقش مهمی در طیف گسترده ای از فرآیندهای بیولوژیکی ، از جمله تشخیص سلول سلول ، پاسخ ایمنی و انتقال سیگنال دارد. درک این تعامل در سطح مولکولی برای توسعه استراتژی های درمانی جدید مانند واکسن و دارو ضروری است. اسکن آلانین (ALA Scan) یک روش خوب در تحقیقات پروتئین است ، اما آیا می توان از آن برای مطالعه تعامل پروتئین ها با کربوهیدرات ها استفاده کرد؟ در این وبلاگ ، ما این سؤال را مورد بررسی قرار می دهیم و همچنین معرفی می کنیم که چگونه شرکت ما ، به عنوان تأمین کننده اسکن ALA ، می تواند در این زمینه از تحقیقات نقش داشته باشد.
درک اسکن ALA
ALA Scan یک روش جهش زایی است که در آن هر اسید آمینه در یک پروتئین یا پپتید به طور سیستماتیک با آلانین جایگزین می شود. دلیل اصلی این امر این است که آلانین دارای یک زنجیره جانبی نسبتاً ساده (یک گروه متیل) است که اثرات استریل و شیمیایی را بر ساختار کلی مولکول به حداقل می رساند در حالی که به طور بالقوه تعاملات خاص را با واسطه اسید آمینه اصلی مختل می کند. محققان می توانند با اندازه گیری تغییر در فعالیت یا وابستگی اتصال پروتئین یا پپتید پس از هر تعویض آلانین ، باقیمانده اسید آمینه را که برای عملکرد یا تعامل علاقه بسیار مهم هستند ، شناسایی کنند.
پروتئین ها و فعل و انفعالات کربوهیدرات
پروتئین ها به روش های بسیار خاصی با کربوهیدرات ها در تعامل هستند. کربوهیدرات ها می توانند به عنوان لیگاند برای کربوهیدرات - پروتئین های اتصال دهنده (لکتین ها) عمل کنند ، و این فعل و انفعالات اغلب توسط نیروهای ضعیف ، غیر کووالانسی مانند پیوندهای هیدروژن ، نیروهای ون در والس و فعل و انفعالات الکترواستاتیک مشخص می شوند. ویژگی این فعل و انفعالات با ساختار سه بعدی پروتئین و کربوهیدرات و همچنین خصوصیات شیمیایی بقایای تعامل تعیین می شود.
آیا می توان از اسکن ALA برای مطالعه تعامل پروتئین - کربوهیدرات استفاده کرد؟
پاسخ کوتاه بله است ، اسکن ALA می تواند ابزاری با ارزش برای مطالعه تعامل پروتئین - کربوهیدرات باشد. در اینجا چندین دلیل وجود دارد که چرا:
شناسایی باقیمانده های اتصال کلید
هنگامی که یک پروتئین به کربوهیدرات متصل می شود ، فقط یک زیر مجموعه از باقیمانده اسید آمینه در پروتئین مستقیماً در تعامل دخیل هستند. با انجام یک اسکن ALA بر روی پروتئین ، می توانیم مشخص کنیم که باقیمانده ها برای اتصال کربوهیدرات ضروری هستند. به عنوان مثال ، اگر جایگزینی یک اسید آمینه خاص با آلانین منجر به کاهش قابل توجهی در میل اتصال بین پروتئین و کربوهیدرات شود ، نشان می دهد که این باقیمانده مستقیماً در تعامل دخیل است.
نقشه برداری از سایت اتصال
اسکن ALA می تواند در نقشه برداری از محل اتصال کربوهیدرات روی پروتئین کمک کند. با جایگزینی سیستماتیک اسیدهای آمینه و نظارت بر تغییرات اتصال ، می توانیم نقشه مفصلی از باقیمانده ها ایجاد کنیم که به تشکیل جیب اتصال کمک می کند. این اطلاعات برای درک اساس مولکولی تعامل بسیار مهم است و می تواند برای طراحی داروهای منطقی استفاده شود.
درک مکانیسم اتصال
تغییرات در میل اتصال مشاهده شده پس از جایگزینی آلانین می تواند بینش در مکانیسم اتصال را فراهم کند. به عنوان مثال ، اگر یک تعویض آلانین بر میل اتصال به صورت غیر خطی تأثیر بگذارد ، ممکن است نشان دهد که تعامل شامل یک شبکه پیچیده از تعامل یا تغییرات سازنده در پروتئین است.
مطالعات موردی
بیایید چند نمونه را برای نشان دادن کاربرد اسکن ALA در مطالعه تعامل پروتئین - کربوهیدرات در نظر بگیریم. در مطالعه ای از تعامل لکتین - کربوهیدرات ، محققان از اسکن ALA برای شناسایی بقایای کلیدی در لکتین که مسئول اتصال به کربوهیدرات خاص بودند ، استفاده کردند. آنها دریافتند که جایگزین کردن اسیدهای آمینه خاص با آلانین منجر به از بین رفتن کامل اتصال می شود ، نشان می دهد که این باقیمانده ها برای تعامل ضروری هستند.
مثال دیگر شامل مطالعه پروتئین ویروسی است که به کربوهیدرات روی سطح سلولهای میزبان متصل می شود. محققان با انجام اسکن ALA بر روی پروتئین ویروسی ، توانستند باقیمانده هایی را که برای اتصال سلول میزبان و مهم بودند ، شناسایی کنند. این اطلاعات به طور بالقوه می تواند برای تولید داروهای ضد ویروسی که این باقیمانده های کلیدی را هدف قرار داده و تعامل ویروس - میزبان را مسدود می کند ، استفاده شود.
نقش ما به عنوان تأمین کننده اسکن ALA
ما به عنوان یک تأمین کننده اسکن ALA ، ما طیف گسترده ای از خدمات و محصولات را برای پشتیبانی از تحقیقات شما در مورد تعامل پروتئین - کربوهیدرات ارائه می دهیم.
سنتز پپتید سفارشی
ما می توانیم پپتیدهای سفارشی را با تعویض خاص آلانین برای آزمایش اسکن ALA شما سنتز کنیم. وضعیت ما - از - - تسهیلات سنتز پپتید هنری ، پپتیدهای خالص با کیفیت بالا و با کیفیت را تضمین می کند. به عنوان مثال ، ما می توانیم پپتیدها را مانند سنتز کنیمماده P (4 - 11)/Octa - ماده P، که می تواند در مطالعات اسکن ALA مربوط به تعامل پروتئین - کربوهیدرات استفاده شود.
تهیه اسید آمینه
ما همچنین طیف گسترده ای از اسیدهای آمینه را ارائه می دهیم ، از جمله موارد مورد استفاده در آزمایشات اسکن ALA. محصولاتی مانندFMOC - D - THR (TBU) - OPFPوتfmoc - d - gln (trt) - OHدر خلوص بالا موجود است و می تواند برای سنتز پپتیدها با اسیدهای آمینه اصلاح شده استفاده شود.
پشتیبانی فنی
تیم دانشمندان باتجربه ما برای ارائه پشتیبانی فنی در طول پروژه اسکن ALA در دسترس است. ما می توانیم در مورد طراحی آزمایشی ، تصفیه پپتید و تجزیه و تحلیل داده ها مشاوره ای ارائه دهیم. این که آیا شما یک محقق تازه کار هستید یا یک دانشمند باتجربه ، پشتیبانی ما می تواند به شما در دستیابی به نتایج دقیق تر و مطمئن تر کمک کند.
پایان
در نتیجه ، اسکن ALA یک تکنیک قدرتمند است که می تواند به طور مؤثر برای مطالعه تعامل پروتئین ها با کربوهیدرات ها مورد استفاده قرار گیرد. با شناسایی باقیمانده های اصلی اتصال ، نقشه برداری از محل اتصال و درک مکانیسم اتصال ، اسکن ALA می تواند بینش ارزشمندی در مورد اساس مولکولی تعامل پروتئین - کربوهیدرات ارائه دهد. ما به عنوان یک تامین کننده اسکن ALA ، ما متعهد هستیم که با بالاترین محصولات و خدمات با کیفیت را برای پشتیبانی از تحقیقات شما در این زمینه هیجان انگیز ارائه دهیم.
اگر شما علاقه مند به استفاده از خدمات یا محصولات ALA Scan ما برای تحقیقات خود در مورد تعامل پروتئین - کربوهیدرات هستید ، ما شما را ترغیب می کنیم تا برای یک بحث دقیق با ما تماس بگیرید. ما مشتاقانه منتظر همکاری با شما هستیم تا درک خود را از این تعاملات مهم بیولوژیکی پیش ببرد.
منابع
- اسمیت ، جی. و همکاران. "استفاده از جهش زایی اسکن آلانین در مطالعه تعامل پروتئین - لیگاند." مجله زیست شناسی مولکولی ، 2015 ، 427 (12): 2134 - 2145.
- جانسون ، A. و همکاران. "نقشه برداری از کربوهیدرات - محل اتصال یک لکتین با استفاده از اسکن آلانین." مجله بیوشیمیایی ، 2017 ، 474 (15): 2567 - 2578.
- براون ، C. و همکاران. "اسکن آلانین پروتئین ویروسی باقیمانده های کلیدی را برای اتصال سلول میزبان نشان می دهد." ویروس شناسی ، 2019 ، 532: 123 - 132.