بسترهای پپتید نقش مهمی در زمینه های مختلف تحقیقات بیوشیمیایی و بیولوژیکی از جمله سنجش فعالیت آنزیم ، کشف مواد مخدر و پروتئومیک دارند. اصلاح بسترهای پپتید اغلب برای تقویت ثبات ، ویژگی و عملکرد آنها انجام می شود. من به عنوان یک تأمین کننده بسترهای پپتید ، من در اصلاحات مشترک بسترهای پپتید ، که در این وبلاگ توضیح خواهم داد ، خوب هستم.
1. اصلاحات شیمیایی در N - Terminus
پایانه N - پپتید یکی از متداول ترین سایت ها برای اصلاح است. یکی از ساده ترین و رایج ترین تغییرات استیلاسیون است. استیلاسیون شامل افزودن یک گروه استیل به گروه آمینو ترمینال N است. این اصلاح چندین مزیت دارد. در مرحله اول ، می تواند پپتید را در برابر تخریب توسط آمینوپپتیدازها ، که آنزیم هایی هستند که پپتیدها را از پایانه N- جدا می کنند ، محافظت کند. به عنوان مثال ، در آزمایشات کشت سلول در شرایط آزمایشگاهی ، بسترهای پپتید استیله شده با ثبات تر هستند و می توانند یکپارچگی خود را برای مدت طولانی تر حفظ کنند و از نتایج تجربی قابل اطمینان تری اطمینان حاصل کنند.
یکی دیگر از اصلاحات مهم ترمینال ، افزودن یک گروه فلورسنت یا کروموژنیک است. برچسب های فلورسنت مانند ایزوتیوسیانات فلورسئین (FITC) یا رودامین را می توان به پایانه N وصل کرد. این پپتیدهای دارای برچسب به طور گسترده در سنجش فعالیت آنزیم مبتنی بر فلورسانس استفاده می شوند. هنگامی که آنزیم بر روی بستر پپتید عمل می کند ، سیگنال فلورسنت تغییر می کند و امکان نظارت واقعی از واکنش آنزیمی را فراهم می کند. به عنوان مثال ، در سنجش فعالیت پروتئاز ، از یک بستر پپتید با برچسب FITC می توان برای اندازه گیری فعالیت پروتئاز با تشخیص تغییر در شدت فلورسانس در طول زمان استفاده کرد.
2. اصلاحات شیمیایی در C - Terminus
مشابه با پایانه N ، پایانه C - یک پپتید نیز هدف اصلاح است. AMIDATION یک اصلاح متداول C - Terminal است. با جایگزینی گروه کربوکسیل C - ترمینال با یک گروه آمید ، پپتید در برابر کربوکسیپپتیدازها ، که پپتیدهای C - پاپتیدها را جدا می کنند ، مقاوم تر می شوند. پپتیدهای درآید اغلب در سیستم های بیولوژیکی پایدار هستند و می توانند خاصیت فارماکوکینتیک را بهبود بخشند.
علاوه بر این ، پایانه C می تواند با گروه های مختلف عملکردی برای برنامه های خاص اصلاح شود. به عنوان مثال ، پیوست یک گروه بیوتین در C - Terminus امکان تصفیه آسان و تشخیص پپتید را فراهم می کند. پپتیدهای بیوتینیله شده را می توان با استفاده از دانه های روکش شده استرپتاویدین ، که یک روش متداول در مطالعات تعامل پروتئین - پپتید است ، ضبط کرد. این محققان را قادر می سازد پروتئین های تعامل با ویژگی بالا را جدا و تجزیه و تحلیل کنند.
3. جانبی - تغییرات زنجیره ای
زنجیره های اسیدهای آمینه در یک بستر پپتید نیز می توانند اصلاح شوند. یکی از اصلاحات زنجیره ای شناخته شده - فسفوریلاسیون است. فسفوریلاسیون در گروه های هیدروکسیل باقیمانده سرین ، ترئونین یا تیروزین رخ می دهد. پپتیدهای فسفریله شده برای مطالعه پروتئین کینازها و فسفاتازها ضروری هستند. پروتئین کینازها گروه های فسفات را به بقایای اسید آمینه خاص در پروتئین ها اضافه می کنند ، در حالی که فسفاتازها آنها را از بین می برند. محققان با استفاده از بسترهای پپتید فسفریله شده ، می توانند فعالیت این آنزیم ها را اندازه گیری کرده و مسیرهای سیگنالینگ درگیر در فرآیندهای وابسته به فسفوریلاسیون را بررسی کنند.
نوع دیگری از اصلاح زنجیره ای ، معرفی اسیدهای آمینه غیر طبیعی است. اسیدهای آمینه غیر طبیعی می توانند از خصوصیات شیمیایی و فیزیکی منحصر به فردی برخوردار باشند که در اسیدهای آمینه طبیعی یافت نمی شوند. به عنوان مثال ، برخی از اسیدهای آمینه غیر طبیعی می توانند برای معرفی واکنش پذیری شیمیایی خاص یا تقلید از تغییرات پس از ترجمه استفاده شوند. ترکیب اسیدهای آمینه غیر طبیعی در بسترهای پپتید می تواند دامنه برنامه ها را گسترش داده و عملکرد پپتیدها را در سنجش های مختلف بهبود بخشد.
4. صلیب - پیوند تغییرات
برای پیوند دو یا چند مولکول پپتید به هم یا پیوند دادن یک پپتید به مولکولهای دیگر مانند پروتئین یا اسیدهای نوکلئیک ، از تغییرات متقابل استفاده می شود. صلیب Homobifunctional - پیوندها معمولاً برای پیوند دو گروه عملکردی یکسان بر روی پپتیدهای مختلف یا مولکول ها استفاده می شوند. به عنوان مثال ، induccinimidyl suberate (DSS) یک اتصال دهنده همبازی است که می تواند با آمین های اولیه روی پپتیدها واکنش نشان دهد. این پیوند متقابل می تواند برای مطالعه تعامل پروتئین - پپتید یا ایجاد پلیمرهای مبتنی بر پپتید استفاده شود.
از طرف دیگر ، پیوند دهنده های متقاطع هتروبیف عملکردی دارای دو گروه واکنشی متفاوت هستند که امکان پیوند خاص انواع مختلف مولکول ها را فراهم می کند. به عنوان مثال ، یک اتصال دهنده متقاطع با یک گروه واکنشی آمین و یک گروه واکنشی سولفیدریل می تواند برای پیوند یک پپتید با پروتئینی که دارای یک گروه سولفیدریل رایگان است ، استفاده شود. همچنین می توان از تغییرات پیوند دهنده برای ایجاد ترکیبات پپتیدی استفاده کرد ، که کاربردهای بالقوه ای در تحویل دارو و درمان هدفمند دارند.
5. نمونه هایی از بسترهای پپتید اصلاح شده
ما طیف گسترده ای از بسترهای پپتید اصلاح شده را ارائه می دهیم. به عنوان مثال ،mu-val-fmkیک بستر پپتید با اصلاحات خاص است. برای استفاده در سنجش فعالیت کاسپاز طراحی شده است. اصلاحات در این بستر پپتید ویژگی آن را نسبت به کاسپازها افزایش می دهد و امکان اندازه گیری دقیق فعالیت کاسپاز را فراهم می آورد.
Z-Val-Phe-choیکی دیگر از بستر های مهم پپتید است. این یک بستر پپتید مهار کننده Calpain است. اصلاحات در این پپتید آن را به یک مهار کننده قدرتمند از کالپین تبدیل می کند ، پروتئاز مهمی که در بسیاری از فرآیندهای فیزیولوژیکی و پاتولوژیک دخیل است. با استفاده از این بستر پپتید ، محققان می توانند نقش کالپین را در سیستم های مختلف بیولوژیکی بررسی کرده و داروهای بالقوه ای را که کالپین را هدف قرار می دهند ، تولید کنند.
مهار کننده کالپین xiهمچنین یک محصول ارزشمند در کاتالوگ ما است. این تغییرات خاص دارد که آن را به یک مهار کننده بسیار مؤثر از Calpain تبدیل می کند. این بستر پپتید را می توان در مطالعات آزمایشگاهی و داخل بدن برای بررسی عملکرد کالپین و تدوین استراتژی های درمانی برای بیماری های مرتبط با کالپین استفاده کرد.
6. اهمیت بسترهای پپتید اصلاح شده در تحقیق و صنعت
بسترهای پپتید اصلاح شده هم در تحقیقات و هم در صنعت از اهمیت زیادی برخوردار هستند. در زمینه تحقیق ، آنها ابزارهای اساسی برای مطالعه عملکرد آنزیم ، فعل و انفعالات پروتئین و پروتئین و مسیرهای سیگنالینگ هستند. به عنوان مثال ، در تحقیقات سرطان ، از بسترهای پپتید اصلاح شده می توان برای مطالعه فعالیت پروتئازها که در تهاجم تومور و متاستاز نقش دارند ، استفاده شود. محققان با درک نقش این پروتئازها ، می توانند داروهای جدید ضد سرطان ایجاد کنند.
در صنعت داروسازی ، از بسترهای پپتید اصلاح شده در کشف و توسعه دارو استفاده می شود. آنها می توانند به عنوان ترکیبات اصلی برای تولید داروهای جدید یا به عنوان کاوشگر برای غربالگری نامزدهای بالقوه دارو استفاده شوند. به عنوان مثال ، یک بستر پپتید اصلاح شده که به طور خاص می تواند یک آنزیم مرتبط با بیماری را مهار کند ، می تواند برای ایجاد یک داروی قوی تر و انتخابی بیشتر بهینه شود.
7. نتیجه گیری و فراخوانی به عمل
در نتیجه ، تغییرات مشترک بسترهای پپتید شامل N - Terminal ، C - Terminal ، Side - Chain و Linking Linking Linking است. این اصلاحات باعث افزایش ثبات ، ویژگی و عملکرد بسترهای پپتید می شود و آنها را ابزارهای ضروری در تحقیقات مختلف و کاربردهای صنعتی می کند. ما به عنوان یک تأمین کننده بسترهای پپتید ، ما متعهد هستیم که بسترهای پپتید اصلاح شده با کیفیت بالا را برای تأمین نیازهای متنوع مشتریان ارائه دهیم.
اگر به بسترهای پپتید ما علاقه دارید یا در مورد اصلاحات پپتید سؤالی دارید ، لطفاً برای بحث و تهیه بیشتر با ما تماس بگیرید. ما بیش از این خوشحالیم که به شما در یافتن مناسب ترین بسترهای پپتید برای تحقیق یا پروژه های صنعتی خود کمک کنیم.
منابع
- Creighton ، TE (1993). پروتئین ها: ساختارها و اصول مولکولی. WH فریمن و شرکت.
- Nelson ، DL ، & Cox ، MM (2008). اصول بیوشیمیایی Lehninger. WH فریمن و شرکت.
- واکر ، JM (2002). کتاب پروتکل پروتکل. Humana Press.